Данная проблема связана скорее с настройками загрузки. В качестве решения можно попробовать:
- переключить SATA порты дисков (HDD в порт, где SSD)
- использовать прог-у EasyBCD
- удалить в BIOS ненужный загрузчик, например, Windows Boot Disk (HDD).